С августа 1992 г. по январь 1993 г. – командир транспортного авиационного отряда.
В 1993—2009 гг. – командующий военно-воздушными силами Абхазии.
За время войны дополнительно освоил самолёты - Л-39, Як-52 и вертолет Ми-8, выполнял полёты по доставке оружия и боеприпасов на Восточный фронт, а также боевые полёты по уничтожению живой силы и техники противника.
После войны принимал участие в ликвидации диверсионно-террористической группы в Гулрыпшском районе (1997), в антитеррористической операции в Кодорском ущелье (октябрь 2001), освобождении верхней части Кодорского ущелья (август 2008).
В 2003 – 2004 гг. Вячеслав Эшба, будучи командующим ВВС РА, одновременно возглавлял Минобороны РА.
В 2009 году ушёл в отставку с поста командующего ВВС РА.
С 2009 – генеральный директор Сухумского международного аэропорта им. В. Г. Ардзинба.