На эти темы ученым написано более 200 научных статей. Более 100 научных статей Скакова было посвящено современной истории Кавказа.

Он автор  нескольких книг, многочисленных научно-популярных статей и интервью, ряда работ по культурологии.

Особый вклад в дело развития абхазской археологии исследователь внес в ходе совместных абхазо-российских экспедиций в Гудаутском, Ткуарчалском и Очамчырском районах Абхазии (Джантухский могильник, раннеантичное поселение Гюэнос).

Александр Юрьевич  также принимал участие в археологических работах на территории Кодорского ущелья, в составе Сочинской археологической экспедиции ИА РАН, в Республике Южная Осетия, на территории Краснодарского края, Республики Северная Осетия – Алания, Кабардино-Балкарской Республики и других регионах РФ.

«За годы сотрудничества с Абхазским государственным музеем и его директором  А. И. Джопуа в научный оборот были введены сотни археологических предметов из металла, керамики и камня. В 2015 г. за свою плодотворную деятельность А. И Скаков был удостоен звания заслуженного деятеля науки Республики Абхазия. С 2020 г. работал в должности заместителя директора Института востоковедения РАН.

Александр Юрьевич был настоящим профессионалом своего дела и большим другом Абхазии», – отмечается в  сообщении коллектива Абхазского государственного музея.

Руководство и коллектив музея выражают глубокие соболезнования родным и близким усопшего.

«Уход такого светлого человека – это тяжелая утрата и великая скорбь для всех нас», –  отмечается в сообщении.