Е. П. Шакрыл родилась 23 октября 1924 г. в с. Лыхны Гудаутского района в семье известного абхазского просветителя Платона Семеновича Шакрыл. После окончания Сухумского государственного педагогического института им А. М. Горького в 1946 году была направлена на работу в Ачандарскую среднюю школу преподавателем русского языка и литературы. С 1948 г. Е. П. Шакрыл продолжила  учебу в Москве. В 1954 г. после завершения учебы в аспирантуре Института языкознания Е. П. Шакрыл успешно защитила диссертацию на соискание ученой степени кандидата филологических наук в Институте языкознания АН СССР. Работа «Послелоги в абхазском языке" получила высокую оценку.

С 1954 г. Шакрыл работала научным сотрудником Абхазского института языка, литературы и истории им. Д. И. Гулиа и одновременно преподавателем филологического факультета Сухумского пединститута, где первой начала читать курс лекций по абхазской грамматике на абхазском языке.

Екатерина Платоновна вместе со своей сестрой Тамарой Платоновной Шакрыл при поддержке директора института А. Ф. Хонелия подготовили необходимые материалы для создания кафедры абхазского языка и литературы, которая впоследствии была открыта в 1956 г.

Несколько десятилетий, с 1962 по 1992 гг., Е.П. Шакрыл – доцент кафедры абхазского языка пединститута, а затем – Абхазского государственного университета. В своей преподавательской деятельности Екатерина Шакрыл, обладая широким диапазоном научных знаний, вела основные курсы на кафедре абхазского языка. Ею были разработаны совершенно новые для Абхазского университета спецкурсы по сравнительной типологии абхазского и русского языков, по морфологии и синтаксису абхазского языка.

С 1994 г. Е Шакрыл – старший научный сотрудник АбИГИ им Д. Гулиа AHA. Ее перу принадлежат свыше 35 исследовательских работ. Круг ее научных интересов был обширен, ее внимание привлекали морфология, синтаксис, лексикология, лексикография абхазского языка. Она является автором и соавтором ряда фундаментальных работ и учебных пособий: «Грамматика абхазского языка. Фонетика и морфология» (1968); «Сборник материалов по абхазскому языку» (1976); «Русско-абхазский словарь» (1964); «Русско-абхазский общественно-политический терминологический словарь» (1991); «Русско-абхазский терминологический словарь» (2000).

Екатерина Шакрыл была известна и как прекрасный переводчик – она перевела на абхазский язык «Рождение человека» А. М. Горького, отрывок «Героизм Птахи» из романа «Рожденные бурей» Н. А. Островского, а также очерк известного французского писателя Анри Барбюса «Среди красот земного рая». Из указанных переводов первые два входили в учебные программы абхазских школ.

За плодотворную научно-преподавательскую деятельность Е. П. Шакрыл награждалась почетными грамотами Верховного Совета Абхазии, ей присвоено высокое звание «Заслуженный работник высшей школы» (1985).

Вся жизнь Е.П. Шакрыл была посвящена интересам абхазского народа. В тяжелейшие для абхазского народа времена, в 1952 году, когда были закрыты абхазские школы, когда запрещали даже говорить на абхазском языке, Екатерина Платоновна и Тамара Платоновна Шакрыл, будучи аспирантками, написали письмо Сталину об ущемлении прав абхазского народа. После смерти Сталина в Москве по данному письму была создана правительственная комиссия, работа которой послужила началом процесса преодоления десятилетиями проводимой антиабхазской политики.

Помимо ценного вклада в абхазоведение Екатерина Платоновна Шакрыл сыграла огромную роль в подготовке и воспитании целых поколений исследователей и преподавателей абхазского языка для средних школ и других учебных заведений.

Е. П. Шакрыл была среди тех представителей абхазской интеллигенции, кто в тяжелейшие годы закладывал прочную основу для восстановления исторической справедливости. Наш народ всегда будет помнить о ее высоком патриотизме и беззаветном служении науке и просвещению Абхазии.