Основная задача институтов заключалась в разработке промышленных методов разделения изотопов урана, создании аппаратуры для анализа и измерения изотопных концентраций, а также вспомогательной аппаратуры для ядерных исследований. Это означало разработку технологии получения делящегося материала для создания ядерного оружия с целью прекращения монополии США на использование ядерной энергии в военных целях.   

Институт «А» возглавил ученый с мировым именем, один из основоположников телевидения и создателей электронного микроскопа – Манфред фон Арденне (1907-1997). Директором Института «Г» был назначен не менее знаменитый ученый, лауреат Нобелевской премии по физике Густав Герц (1887-1975).

Немецкие  специалисты работали в  двух институтах в течение 10 лет –  с 1945 по 1955 годы. В это время разрабатывались в основном три метода разделения изотопов урана: газодиффузионный, электромагнитный и центрифужный.

Значительная часть результатов этих работ нашла промышленное применение и была внедрена на обогатительных заводах урана.

1 июля 1950 г. по постановлению Совета Министров СССР на базе обоих объектов был создан Сухумский физико-технический институт (СФТИ), который до распада Советского Союза был частью научно-производственного комплекса Министерства среднего машиностроения СССР.

К 1956 году, с отъездом основной группы немецких специалистов, начался процесс перепрофилирования института на "несекретную тематику" и формирования новых научных направлений.

Институт постепенно вырос в мощный научный центр с современной экспериментальной базой, обеспечивающей проведение полного цикла научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ в области разделения изотопов, физики плазмы и управляемого термоядерного синтеза, ускорительной техники, физики полупроводников и прямого преобразования тепловой энергии в электрическую.

Значительная часть исследований по сформированным направлениям была доведена до опытных разработок с последующим применением и внедрением их в различных областях атомной науки и техники.

В 1958 году СФТИ включился в программу по созданию космической ядерной энергетической установки. Первая в мире установка с преобразованием тепловой энергии ядерного реактора в электрическую с выходной мощностью 500 Вт была запущена в 1964 г.  и проработала 12 000 часов, продемонстрировав принципиальную возможность создания таких источников электроэнергии для космических аппаратов. Затем был создан целый ряд радиоизотопных термоэлектрических генераторов как для космического, так и для наземного применения.

В 1981 году за успехи в развитии науки и техники СФТИ был награждён орденом Трудового Красного Знамени.

С 1996 года институтом руководит Анатолий Марколия.

В трудных условиях первых послевоенных лет и  экономической блокады удалось в  основном сохранить  научно-технологическую  базу и основной состав сотрудников. Институт  возобновил прерванные научные связи с предприятиями Госкорпораций «Росатом» и «Роскосмос».

В 2005 году запущена плазмофокусная установка четвёртого поколения КПФ-4. По энергетике она входит в тройку крупнейших в мире. Ведутся исследования по моделированию астрофизических джетов и воздействия высокоростных (~100 км/с) плазменных потоков на материалы.

В 2015 году была изобретена новая технология извлечения эфирных масел из растений с помощью сверхвысокочастотного излучения. Была сконструирована и изготовлена полупромышленная установка с высокоскоростным нагревом растительного сырья. 

Как рассказал Апсныпресс заместитель директора СФТИ по научной работе Борис Лазба, сегодня в институте работают около 250 человек. Как и в предыдущие годы, продолжается работа с «Росатомом».  

«Есть определенные задачи, которые мы совместно решаем.  Они связаны с преобразованием тепловой энергии в электрическую, термоэлектричеством и термоэмиссией. Временно законсервированы проекты по ускорительной технологии и  физики плазмы», – сказал он.

Подписан договор о сотрудничестве между Академией наук Абхазии, в структуру которой входит СФТИ,  и Научно-исследовательским центром «Курчатовский институт».

«Мы планируем заниматься развитием ускорительных технологий. Это  также имеет отношение к ядерной медицине. Если мы сможем с Курчатовским институтом наладить взаимодействие по ускорительной тематике, там может быть такое направление, как ядерная медицина. Это очень в Абхазии востребовано, потому что речь идет о ранней диагностике и лечении онкологических заболеваний. Мы также говорим о создании фармпрепаратов», - сообщил Лазба.

СФТИ также занимается созданием товаров народного потребления, в том числе опрыскивателей сельскохозяйственных растений, различных емкостей из нержавеющей стали  для воды и  вин, перегонных  кубов  и др.